Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MLH1P40692 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms