Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 RHOJ-202ENST00000555125 548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRHP20396 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRHP20396 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 AC109460.2-202ENST00000568057 573 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 AC007032.1-201ENST00000609281 847 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRHP20396 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRHP20396 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRHP20396 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRHP20396 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRHP20396 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRHP20396 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms