Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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