Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCP1P17987 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCP1P17987 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms