Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms