Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms