Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC6Q9UBN7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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