Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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