Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CECR2Q9BXF3 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CECR2Q9BXF3 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms