Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms