Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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