Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RFT1Q96AA3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms