Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms