Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC12Q8WUD4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms