Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
STRIP1Q5VSL9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms