Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms