Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CCDC96Q2M329 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CCDC96Q2M329 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CCDC96Q2M329 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CCDC96Q2M329 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CCDC96Q2M329 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CCDC96Q2M329 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CCDC96Q2M329 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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