Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SYT16Q17RD7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SYT16Q17RD7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.6 ms