Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms