Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIP4K2AP48426 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms