Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AFMP43652 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AFMP43652 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AFMP43652 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms