Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
BRS3P32247 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms