Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRMP28827 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRMP28827 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRMP28827 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRMP28827 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRMP28827 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PTPRMP28827 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRMP28827 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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