Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP4AP20648 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms