Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCNA2P20248 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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