Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms