Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPRKBQ9Y3C4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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TPRKBQ9Y3C4 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TPRKBQ9Y3C4 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TPRKBQ9Y3C4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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