Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms