Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PKD2L1Q9P0L9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD2L1Q9P0L9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms