Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms