Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms