Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LETM2Q2VYF4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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