Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKOR2Q2VWA4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms