Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms