Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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