Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FRMPD4Q14CM0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms