Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNA1SQ13698 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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