Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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