Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms