Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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