Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms