Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms