Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRA2BP62995 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRA2BP62995 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms