Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GFRA1P56159 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms