Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA2D1P54289 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms