Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms