Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP4P49662 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP4P49662 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms