Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNFSF9P41273 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms