Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms