Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms